父亲听完了儿子的陈述，耐心地向他解释说：“小熊（竺可桢的小名）啊，这就叫作‘水滴石穿’呀！”竺可桢迫不及待地打断父亲的话：“柔软的水滴怎么能弄穿坚硬的石头呢？”父亲语重心长地说：“别看一滴一滴的雨水没有什么棱角，很柔软，但是，天长日久，坚硬的石板就被滴出小坑了。读书、学习，办其他的事情，都是这个道理，只要你能持之以恒，就会有所成就。”竺可桢把这件事深深地记在心里。从此，“水滴石穿”成了他的座右铭。他一直用这句话激励自己，学习成绩也一直名列前茅。
1905年，竺可桢从章老先生那里出徒，考入上海的澄衷学堂。当时，父亲的粮栈生意很惨淡，家里的经济异常拮据。他觉得儿子已经长大，也学到一些本领，就不打算让他继续读书了。竺可桢坚决不同意，要求继续上学。父亲没想到儿子态度这么坚决，就生气地说：“这个家到底是你说了算，还是我说了算？”竺可桢也不示弱：“在家里是你说了算，但我已经长大了，有权在决定前途命运的问题上做出自己的决定。现在，我们的国家贫穷落后，备受欺凌，只有上学读书，才能学到大本领，让祖国繁荣富强起来……”父亲十二分的不耐烦，说：“你不要跟我说这些没用的，我只知道干活，挣钱，吃饭。”见父亲这样说，竺可桢反驳道：“当初，是你给我讲水滴石穿的故事，告诉我做事情要持之以恒的道理。现在，学还没有上完就叫我退学的，也是你。”这句话让父亲哑口无言，但还是不松口。后来，在章老先生的劝说下，父亲才勉强同意了竺可桢的请求。